中正大學課程大綱
課程名稱(中文)： 生物資訊演算法 開課單位： 資訊工程研究所(Graduate Institute of Computer Science and Information Engineering)
課程名稱(英文) Algorithms in Bioinformatics 課程代碼 4105911_01
授課教師： 黃耀廷 學分數 3
必/選修 選修 開課年級
先修科目或先備能力：
Data structure, Algorithms
課程概述：
本課程以介紹生物資訊概論為基礎, 以各種高速DNA定序技術與生物晶片之軟體設計為主軸, 以期培養生物資訊軟體之人才
學習目標：
1. 以培養解決生物資訊問題及專題策畫與研究為指標
2. 以能閱讀整理並報告生物資訊技術文件為目標
教科書：

課程大綱 分配時數 核心能力 備註
單元主題 內容綱要 講授 示範 隨堂作業 其他
Introduction to DNA Sequencing
Introduction to DNA Sequencing technologies and genome sequencing pojects
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String Comaprison Algorithms
Fundamental and advanced alignment algorithms
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Assembly graph models
Introduction to modern assembly graph models
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Chainning Algorithms
Fundamental and advanced chaining algorithms
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Statistics
Introduction to statistical theoy applied on bioinformatics problems
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Final Project
A term project will be conducted to solve a real bioinforrmatics problem
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教育目標
1.具獨立從事學術研究或產品創新研發之人才
2.具團隊合作精神及科技整合能力，並在團隊中扮演領導、規劃、管理之角色
3.具自我挑戰與終身學習能力之人才
4.具有學術倫理、工程倫理、國際觀之人才

核心能力
1.具有資訊工程與科學領域之專業知識(Competence in computer science and computer engineering.)
2.具有創新思考、問題解決、獨立研究之能力(Be creative and be able to solve problems and to perform independent research.)
3.具有撰寫中英文專業論文及簡報之能力(Demonstrate good written, oral, and communication skills, in both Chinese and English.)
4.具策劃及執行專題研究之能力(Be able to plan and execute projects.)
5.具有溝通、協調、整合及進行跨領域團隊合作之能力(Have communication, coordination, integration skills and teamwork in multi-disciplinary settings.)
6.具有終身學習與因應資訊科技快速變遷之能力(Recognize the need for, and have the ability to engage in independent and life-long learning.)
7.認識並遵循學術與工程倫理(Understand and commit to academic and professional ethics.)
8.具國際觀及科技前瞻視野(Have international view and vision of future technology.)

請尊重智慧財產權，不得非法影印教師指定之教科書籍

教學要點概述：
1. 教材編選(可複選)：自編簡報(ppt)教科書作者提供
2. 教學方法(可複選)：講述板書講述
3. 評量工具(可複選)：上課點名 0%, 隨堂測驗0%, 隨堂作業20.00%, 程式實作0%, 實習報告0%,
                       專案報告0%, 期中考20.00%, 期末考0%, 期末報告60.00%, 其他0%,
4. 教學資源：課程網站 教材電子檔供下載 實習網站
5. 教學相關配合事項：

課程目標與教育核心能力相關性        
請勾選：12345678
1 具有資訊工程與科學領域之專業知識(Competence in computer science and computer engineering.)
為何有關：
生物資訊為培養資訊人才跨領域課程
達成指標：
以培養軟體人才解決生物難題與生資分析之技能為指標
評量工具(可複選)：
以期中考,作業與上課參與表現成績為評量方法 等級5：有繳交80%的作業 或 學期成績可預期達到80分以上 或 報告成績有80分以上 等級4：有繳交60%的作業 或 學期成績可預期達到70分以上 或 報告成績有70分以上 等級3：有繳交40%的作業 或 學期成績可預期達到60分以上 或 報告成績有60分以上 等級2：有繳交20%的作業 或 學期成績可預期達到50分以上 或 報告成績有50分以上 等級1：沒有繳交作業 或 學期成績可預期達到50分以下 或 報告成績有50分以下
2 具有創新思考、問題解決、獨立研究之能力(Be creative and be able to solve problems and to perform independent research.)
為何有關：
生物資訊為新研究領域充滿眾多未知性與未解決之難題
達成指標：
以培養分析生物資訊問題為指標
評量工具(可複選)：
以上課回答表現及期末專題成績為評量方法 等級5：有繳交80%的專題 或 學期成績可預期達到80分以上 或 報告成績有80分以上 等級4：有繳交60%的專題 或 學期成績可預期達到70分以上 或 報告成績有70分以上 等級3：有繳交40%的專題 或 學期成績可預期達到60分以上 或 報告成績有60分以上 等級2：有繳交20%的專題 或 學期成績可預期達到50分以上 或 報告成績有50分以上 等級1：沒有繳交專題 或 學期成績可預期達到50分以下 或 報告成績有50分以下
4 具策劃及執行專題研究之能力(Be able to plan and execute projects.)
為何有關：
本課程培養獨立策劃執行生物資訊專題之能力
達成指標：
以培養解決生物資訊問題及專題策畫與研究為指標
評量工具(可複選)：
以期末專題成績為評量方法 等級5：有繳交80%的專題 或 學期成績可預期達到80分以上 或 報告成績有80分以上 等級4：有繳交60%的專題 或 學期成績可預期達到70分以上 或 報告成績有70分以上 等級3：有繳交40%的專題 或 學期成績可預期達到60分以上 或 報告成績有60分以上 等級2：有繳交20%的專題 或 學期成績可預期達到50分以上 或 報告成績有50分以上 等級1：沒有繳交專題 或 學期成績可預期達到50分以下 或 報告成績有50分以下
5 具有溝通、協調、整合及進行跨領域團隊合作之能力(Have communication, coordination, integration skills and teamwork in multi-disciplinary settings.)
為何有關：
生物資訊常有大量跨領域合作之機會,因此溝通、協調、整合等技能著實重要
達成指標：
以培養溝通、協調、整合技能來完成期末專題為目標
評量工具(可複選)：
以期末專題成績為評量方法 等級5：有繳交80%的專題 或 學期成績可預期達到80分以上 或 報告成績有80分以上 等級4：有繳交60%的專題 或 學期成績可預期達到70分以上 或 報告成績有70分以上 等級3：有繳交40%的專題 或 學期成績可預期達到60分以上 或 報告成績有60分以上 等級2：有繳交20%的專題 或 學期成績可預期達到50分以上 或 報告成績有50分以上 等級1：沒有繳交專題 或 學期成績可預期達到50分以下 或 報告成績有50分以下